在中小企业板市场，中小企业板是主板市场的组成部分，上市的基本条件与主板市场完全一致。按照“两个不变”和“四个独立”的要求，在主板市场法律法规和发行上市标准的框架内，实行包括“独立运作、独立监管、独立代码、独立指数”在内的相对独立管理。中小企业主要安排上市公司中成长性好、流通股本相对较小的公司在主板市场发行。
中国a股市场主板与中小板的主要区别在于:
一、交易规则的差异
1.集合拍卖
主板:集合竞价9:15~9:25开盘，9: 30 ~ 11: 30和13: 00 ~ 15: 00连续竞价，15: 00 ~ 15: 30批量交易。
中小板:集合竞价9: 15 ~ 9: 25开盘，9: 30 ~ 11: 30和13: 00 ~ 14: 57继续竞价，14: 57 ~ 15: 00集合竞价结束，15: 00 ~ 15: 30大宗成交。
2.上午9时20分至9时25分，深交所主机不接受中小企业股票的注销申报。
3.撤回文件的声明
主板:集合竞价市场开市时，交易主机随时接受取消申报。
中小板:集合竞价开盘时，9:20-9:25主持人不接受撤单申报，其他均可接受。
4.收盘价格
主板:由当日最后一笔交易前一分钟所有交易(包括最后一笔交易)的加权平均价格决定。
中小板:集合竞价将于14: 57 ~ 15: 00截止，确定收盘价。如果收盘集合竞价不能产生收盘价，则最后成交价格将是当天的收盘价。
第二，信息披露的差异
在关于中小企业上市公司的特别规定中，年报简报制度的建立表明中小企业上市公司与投资者的关系有望大大拉近。根据规定，中小企业板块上市公司应当在年报披露后召开年报说明会，向投资者介绍公司发展战略、生产经营、新产品和技术开发、财务状况和经营业绩、投资项目等方面的情况。
此外，中小板板块上市公司还被要求在定期报告中披露截至报告期末前十大流通股东持股情况以及公司投资者关系管理的具体情况。也就是说，与主板相比，投资者可以更及时地了解股东持股分布的变化，为投资提供参考。
对于交易信息的披露，中小板除了要像主板一样披露价格偏离度达到7%的前三只股票外，还要增加对日价格波动幅度达到15%、日换手率达到20%的前三只股票的披露要求。
此外，还规定中小企业股票交易出现异常波动的，应当暂停交易。与主板市场明显不同的是，异常波动区间的定义还增加了一个异常换手率的新条件:即连续三个交易日的日均换手率与前五个交易日的日均换手率之比达到30倍，该股票连续三个交易日的累计换手率达到20%。
目前中小企业板和主板的区别不仅仅是交易制度的区别，还有总股本更小。统计显示，主板市场约95%的上市公司总股本超过4亿。根据主板市场的历史数据分析，小盘股的波动性和风险系数都高于指数，这意味着投资中小企业必须能够承受其较大的波动性。